کلیسای سرکیس مقدس یا کلیسای سارکیس مقدس نام یک کلیسای ارمنی در تهران واقع در خیابان کریم خان زند، ابتدای خیابان نجات الهی است. این کلیسا باهزینه شخصی فردی خیر به نام (مارکا سرکیسیان) بنا شد. سرکیس نام یکیاز قدیسان کلیسای حواری ارمنی بوده که به دستور شاپور دوم به قتل رسید.
معماری این کلیسای بزرگ از قرون وسطی و عصر جدید ارمنستان الهام گرفته شده است.
کلیسای سرکیس مقدس با ابعاد سی وشش و نیم متر طول و هجده متر عرض بزرگ ترین کلیسای تهران است و طراحی داخلی آن به یک صلیب شباهت دارد. دیوارهای خارجی بنا با سنگ مرمر سفید و دیوارهای داخلی و سقف با گچ پوشانده شده است. کاشی های به کار رفته در کلیسای سرکیس دارای رنگ سبز تیره می باشند و طرح هایی از گیاهان و حیوانات هم چون نخل ها، میمون، ببر و فیل بر روی آن ها نقش بسته است. سر در ورودی کلیسا با سبک معماری کلیساهای قرن چهارم و پنجم میلادی است و بالکن کلیسا برای اجرای سرودهای روحانی گروه کر در نظر گرفته شده است. این بنا بر روی صفحه نسبتا کوتاهی قرار دارد؛ به طوری که بخش غربی آن به صورت پله هایی در مقابل در ورودی کلیسا در آمده است.
برای کلیسا سه بخش می توان در نظر گرفت. شرقی، غربی، میانی.
قسمت میانی از دو قسمت شرقی و غربی پهن تر است و از هر طرف هفتاد و پنج سانتی متر پهنای بیشتری دارد که گنبد شانزده ضلعی بنا در این قسمت قرار دارد که به وسیله یک چهار ضلعی بر روی چهار طاقی قرار گرفته و بر روی شاه تیرها تکیه دارد.
محراب کلیسا به صورت نیم دایره است و در سمت شرقی بنا قرار دارد. کف آن نیز بالاتر از کف صحن کلیسا و دارای سه نورگیر است. دیوارهای بالای محراب و دو سمت آن با نقاشی های دیواری با موضوعاتی بر گرفته از کتاب مقدس انجیل اثر ادمان آیو زایان پوشیده شده است. بلندی سقف این کلیسا بر گرفته از کلیسای مریم مقدس است. نبود ستون در زیر گنبد سبب شده تا فضایی بسیار وسیع در صحن کلیسا به وجود آید.
این کلیسا دو ناقوس خانه دارد که در دو طرف راهروی ورودی غربی کلیسا و بالای ورودی ساختمان قرار گرفته اند.
کلیسای سرکیس مقدس در سال ۱۳۴۹ هجری شمسی شروع به کار کرد اما در زمان جنگ تحمیلی آسیب دید و مدتی تعطیل شد. چند سال بعد پس از مرمت بخش های آسیب دیده دوباره در سال ۱۳۶۲ فعالیت خود را آغاز کرد. در سال ۱۳۹۱ هم یک بار مورد مرمت و بازسازی قرار گرفت. حوضچه مخصوص غسل تعمید، واقع در گوشه شرقی دیوار شمالی بنا بازسازی و با نقاشی حضرت مسیح تزیین شد.
کلیسای سرکیس مقدس در تاریخ ۱۱ تیر ماه سال ۱۳۹۹ با شماره ثبت ۳۳۰۴۸ در فهرست آثار ملی ایران به ثبت رسیده است.